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目前已知最小的细菌只有0.2微米长 ，因此大多只能在显微镜下被看到 。细菌一般是单细胞 ，细胞结构简单，缺乏细胞核 、细胞骨架以及膜状胞器 ，例如线粒体和叶绿体。基于这些特征 ，细菌属于原核生物（Prokaryote） 。原核生物中还有另一类生物称作古细菌（Archaea），是科学家依据演化关系而另辟的类别 。为了区别 ，本类生物也被称为真细菌（Eubacteria）。 [1]
细菌广泛分布于土壤和水中 ，或者与其他生物共生 。人体身上也带有相当多的细菌 。据估计，人体内及表皮上的细菌细胞总数约是人体细胞总数的十倍。此外，也有部分种类分布在极端的环境中 ，例如温泉 ，甚至是放射性废弃物中，它们被归类为嗜极生物 ，其中最著名的种类之一是海栖热袍菌（Thermotoga maritima） ，科学家是在意大利的一座海底火山中发现这种细菌的 。然而，细菌的种类是如此之多 ，科学家研究过并命名的种类只占其中的小部分 。细菌域下所有门中 ，只有约一半是能在实验室培养的种类。 [1]
细菌的营养方式有自养及异养，其中异养的腐生细菌是生态系中重要的分解者 ，使碳循环能顺利进行。部分细菌会进行固氮作用 ，使氮元素得以转换为生物能利用的形式 。细菌也对人类活动有很大的影响 。一方面，细菌是许多疾病的病原体 ，包括肺结核 、淋病、炭疽病 、梅毒 、鼠疫、砂眼等疾病都是由细菌所引发。然而 ，人类也时常利用细菌，例如乳酪及酸奶的制作 、部分抗生素的制造及废水的处理等，都与细菌有关 。在生物科技领域中 ，细菌也有着广泛的运用 。 [1]
细菌是一种单细胞生物体 ，生物学家把这种生物归入“裂殖菌类 ”。细菌细胞的细胞壁非常像普通植物细胞的细胞壁，但没有叶绿素 。因此 ，细菌往往与其他缺乏叶绿素的植物结成团块 ，并被看作“真菌 ” 。细菌因为特别小而区别于其他植物细胞。实际上，细菌也包括存在着的最小的细胞 。此外 ，细菌没有明显的核 ，而具有分散在整个细胞内的核物质 。因此，细菌有时与被称为“蓝绿藻”的简单植物细胞结成团块 ，蓝绿藻也有分散的核物质 ，但它还有叶绿素。人们越来越普遍地把细菌和其他大一些的单细胞生物归在一起，形成既不属于植物界也不属于动物界的一类生物 ，它们组成生命的第三界——“原生物界 ” 。有些细菌是“病原的 ”细菌 ，其含义是致病的细菌 。然而，大多数类型的细菌不是致病的，而的确常常是非常有用的。例如 ，土壤的肥沃在很大程度上取决于住在土壤中的细菌的活性。“微生物” ，恰当地说，是指任何一种形式的微观生命 。“菌株 ”一词用得更加普遍 ，因为它指的是任何一点小的生命 ，甚至是一个稍大一点的生物的一部分 。例如，包含着实际生命组成部分的一个种子的那个部分就是胚芽 ，因此我们说“小麦胚芽 ”。此外 ，卵细胞和精子（载着最终将发育成一个完整生物的极小生命火花）都称为“生殖细胞” 。然而，在一般情况下 ，微生物和菌株都用来作为细菌的同义词；而且确实尤其适用于致病的细菌 。
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